自2003年起，肛肠外科在区、院领导的支持帮助下，带领一批业务精、思想新、医德高的专业肛肠科医师梯队，凭借着对肛肠科疾病的透彻解析，科学规范化的管理，过硬的专业技术水平，全方位的服务，全力打造并成为杨浦“小肛肠”第一品牌。科室是杨浦区重点学科、国家结直肠息肉管理项目协作中心、中国医师协会中西医结合学会肛肠病专业委员会肛瘘联盟常委级单位、中国便秘联盟理事单位、国家临床重点专科肛肠专科医联体单位。拥有先进电子肛门镜、日本奥林巴斯电子结肠镜290色素放大内镜、奥林巴斯内镜下超声、BK直肠360度腔内腔外超声、加拿大韦斯盆底电生理检查治疗仪、直肠测压仪、金山磁控胶囊内镜。手术：齐备的常规手术器械、史赛克高清腹腔镜系统、强生超声刀、德国爱尔博电外科工作站VODS200/300 爱尔博 海博刀， 德国Storz肛肠镜 ,德国Storz肛瘘镜 德国爱尔博电外科工作站。科室取得科委课题两项,区级课题一项.发表核心期刊文章10余篇，SCI论文数篇。现有医生6人，副主任医师1人，研究生3人，主治医生4人，国际造口师1人。

医疗特色：开展肛门直肠痔疮、肛瘘、肛裂、肛周脓肿的常规良性疾病的微创手术，特别是严重的环状混合痔、复杂性肛瘘、肛周脓肿的一期根治术，顽固性便秘、慢传输便秘、出口梗阻型便秘直肠前突的手术、顽固性便秘的综合治疗、内镜下息肉摘除、粘膜切除术EMR、粘膜剥离术ESD等各类手术治疗、内镜下阑尾炎的逆行治疗ERAT手术；内镜下肠梗阻导管支架的置入；结直肠肿瘤腹腔镜下根治术，超低位保肛术；下肢静脉曲张的微创手术,无需住院，疗效显著；可以说是涵盖了肛门结直肠的所有疾病检查、治疗、手术。